Introducción Conceptos básicos de biología celular y molecular, procesos biologicos y sistemas complejos. La metafora de redes en la era postgenómica: redes de regulación génica, de interacción de proteinas, de señalización, epistasis e interacción genética, relación fenotipo-genotipo. Conceptos del análisis de redes sociales: mundo pequeño, lazos fuertes/débiles, redes en contexto: homofilia, afiliación, selección e influencia social.
Fundamentos de Teoría de Redes Conceptos básicos: tipos de redes y representación, grado de un nodo, caminos en la red, transitividad y reciprocidad, componentes, Laplaciano de un grafo, caminatas al azar, asortatividad. Medidas de centralidad:basadas en distancias y vecindades, basadas en caminos cortos, centralidad de enlaces, indice de Katz, Page Rank, Hubs y authorities. Grafos aleatorios:Erdos Renji, Watts-Strogatz, Modelo configuracional, modelo de Barabasi. Teoria espectral.
Redes biologicas Topologia de redes reales, propiedades generales, modelos de crecimiento de redes. Redes de interaccion de proteinas, hubs y escencialidad. Redes de coexpresion genica. Date/party hubs. Motivos sobrerepresentacion y rol biologico, duplicacion y divergencia.
Estructura en redes
Modelos en bloques. Deteccion de comunidades. Roles, topologia y funcion. Aplicacion a problemas de genomica funcional: asignacion de funcionalidad biologica a productos genicos no caracterizados.
Extraccion de conocimiento embebido en redes Nociones de aprendizaje semi-supervisado. Sistemas de recomendacion y priorizacion en redes. Integracion de datos y dominios de conocimiento. Aplicacion al problema de reposicionamiento de farmacos y analisis redes gen-enfermedad.
