Este es el cronograma tentativo de la materia, que irá evolucionando con el tiempo.
| Día | Teórica | Práctica | Capítulos |
| Mi 18/08 | Intro biología molecular y celular | Biología celular en números |
Nelson: “What’s inside cells”; Philips: “What and Where”
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| Vi 20/08 | Intro biología molecular y celular | Biología celular en números |
Philips: “What and Where”; “A Statistical View of Biological Dynamics”
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| Mi 25/08 | El lado probabilístico de la vida. | Algunas ideas de probabilidad y estadística |
Philips: “A Statistical View of Biological Dynamics”. Dill: “Principles of probability”. Nelson 2: “Randomness in Biology” (caps 3,4,5)
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| Vi 27/08 | Difusión y paseos al azar | Simulaciones varias |
Philips: “A Statistical View of Biological Dynamics”. Dill: “Principles of probability”. Nelson 2: “Randomness in Biology” (caps 3,4,5). Berg: “Diffusion: Microscopic Theory”
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| Mi 1/09 | Difusión y paseos al azar | Simulaciones varias |
Berg: “Diffusion: Microscopic Theory”, “Diffusion: Macroscopic Theory”, “Diffusion with drift”
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| Vi 3/09 | Difusión | Sistemas dinámicos lineales. Espacio de fases. | Berg: “Diffusion: Microscopic Theory”, “Diffusion: Macroscopic Theory”, “Diffusion with drift” |
| Mi 8/09 | Reacciones químicas. Ley de acción de masas. Disociación. Enzimas | Algo de bifurcaciones y atractores. | Nelson: “Enzymes and Molecular Machines”; Keener: “Biochemical reactions”. |
| Vi 10/09 | Enzimas. Michaelis-Menten. Análisis escalas temporales. Inhibición. | Algo más de bifuraciones. Separación escalas temporales. | Keener: “Biochemical reactions”. |
| Mi 15/09 | Enzimas. Cooperatividad. Ejemplos. MWC. | Separación escalas temporales. | Keener: “Biochemical reactions”. |
| Vi 17/09 | Metabolismo. Glucólisis. Oscilaciones glucolíticas | Modelo de Selkov. Bifurcaciones | Keener: “Biochemical reactions”. |
| Mi 22/09 | Membrana celular | Flujo a través de la membrana/consultas | Nelson: “Molecular Machines in Membranes”; Keener: “Cellular homeostasis”. |
| Vi 24/09 | Membrana celular, flujos, corrientes, potencial de membrana, bombas, transportadores | Modelos bombas y transportadores. | Keener: “Cellular homeostasis”. |
| Mi 29/09 | Membrana celular, bombas, canales iónicos. Procesos de Markov. | Modelos bombas y transportadores. Homeostasis celular | Keener: “Membrane Ion Channels” |
| Vi 01/10 | Canales iónicos. Hodgkin-Huxley. Bursting. | Canales iónicos, distintas descripciones | Keener: “Membrane Ion Channels”. “Excitability”. “Neuroendocrine cells” |
| Mi 06/10 | Reacción-difusión. | Consultas. | |
| Vi 08/10 | FERIADO | FERIADO | |
| Mi 13/10 | RAFA | RAFA | |
| Vi 15/10 | RAFA | RAFA/consultas | |
| Mi 20/10 |
Expresión génica.
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Consultas 1er parcial |
Alberts: “From DNA to Protein”; “Control of gene expression”
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| Vi 22/10 |
Vida en entornos desordenados.
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Vida en entornos desordenados | Phillips: “Life in Crowded and Disordered Environments” |
| Mi 27/10 |
Difusión efectiva y difusión anómala
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Reparto papers. Búsqueda, sensing y ruido. | Phillips: “Life in Crowded and Disordered Environments” y papers varios. Bialek: “Noise is not negligible”. |
| Vi 29/10 | Cascadas de señalización | Cascadas de señalización |
Phillips: “Organization of biological networks”
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| Mi 03/11 | Charla invitada (LIP), a las 14:30 | Entropía e Información |
Bialek: “Efficient representation”
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| Vi 05/11 | Charla invitada (AV), a las 14:30 | Entropía e información |
Bialek: “Efficient representation”
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| Mi 10/11 | Consultas | Charla invitada (HG), a las 16:30 | |
| Vi 12/11 | Consultas | Charla Invitada (ACL), a las 16:15 | |
| Mi 17/11 |
Consultas
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Consultas | |
| Vi 19/11 | Consultas | 3 presentaciones estudiantes (empezando a las 16:15!) | |
| Mi 24/11 |
6 presentaciones estudiantes (empezando 14:30)
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| Vi 26/11 | 6 presentaciones estudiantes (empezando 14:30) | Conclusión/Discusión |
En esta página hay links a copias de los capítulos de libros que irán guiando las clases.
