En las ultimas clases hablamos de consumo pasivo de informacion y de como los nuevos modos de contacto social influyen en el flujo de informacion que consumimos…

Como posiblemente ya hayan notado, recientemente WhatsApp limito el numero de receptores de mensajes `reenviados´ como medida para limitar la diseminacion de `fake news´ en relacion a COVID-19 [ link ]

Aca va un link al preprint del trabajo de un grupo brasilero que estudio el tema mediante simulaciones [link]
La buena: se muestra que el limite permite retrasar significativamente la propagacion de informacion
La mala: no es trivial bloquear campañas de desinformacion orquestadas, de contenido altamente viral (en el sentido comunicacional)

Hola a tod@s

Hoy a la maniana tuvo lugar un ‘journal club’ abierto, donde Laszlo Barabasi y colaboradores discutieron algunos puntos de su trabajo sobre el uso de redes para identificar farmacos efectivos contra SARS CoV-2  (Preprint recientemente depositado en bioarXiv).

Aqui les dejo un [ link ] al video de la presentacion. Es un laburo muy compleo, super recomendable para entender como funciona el abordaje de reposicionamiento de farmacos desde la teoria de redes complejas.

Hola! Ya esta subida a la pagina de la materia la video-grabacion de la primer clase. La pueden encontrar, asi como todas las subsiguientes, en la pagina del cronograma de la materia.Nos vemos mañana.

A

Este grupo estudia redes complejas multicapas. En estos dias estan llevando adelante un estudio de #Infodemics que vala la pena chusmear [ https://covid19obs.fbk.eu]. Es un estudio a nivel global del contenido de tweets generados en el marco de la pandemia. Podemos charlar en clase un poco de esto si les apetece

Buenas,

Vamos a armar los grupos en esta planilla. Les pido que vayan agregando su nombre en las casillas de los grupos (hay de sobra, vayan completando desde el Grupo 1 en adelante).

Restricciones: los grupos serán de 2 a 4 personas inclusive y tratemos de que haya diversidad en cuanto a la carrera. Por esto, anoten su carrera también en la columna indicada. La mayoría de ustedes son de física pero debería haber más o menos un biologue por grupo.

Si alguien no figurara en la planilla agréguese al final y mándeme un mail así sabemos.

Por otro lado, dejé el apunte para la guía 1, en versión video y presentación, en la pestaña del Cronograma de la materia de esta página. Si pueden, péguenle una hojeada para la clase de mañana. Veremos algunos conceptos de la guía 1 y también el tutorial de networkx.

Saludos,

Fede

Algunas precisiones sobre el comienzo de clases:

• Si todavia no lo hicieron instalen Zoom en sus computadoras. Les pedimos que creen un usuario con su nombre y pongan una foto con su cara en su perfil.
• Por si necesitan un poco de orientacion..la facultad preparo material acerca de la herramienta Zoom. Lo pueden consultar aqui
• Proximamente les vamos a pasar por mail el nombre del aula y password para poder ingresar a la sesion del martes
• Cuando se conecten a la clase haganlo con microfonos y camaras apagadas. Solo prendan los microfonos para hacer preguntas. Asi evitaremos problemas tecnicos de conectividad y sonido.
• La teorica empezara a las 17 en punto. La primera vez ingresen un ratito antes (16:50) para chequear que no haya problemas de conexion.
• Tengan en cuenta que esto es nuevo para todos. Algunas cosas seguramente van a salir bien y otras quizas cuesten un poco mas. Tengamos eso presente, pongamosle onda y vayamos limando asperezas a medida que avancemos, que seguramente sera una muy linda cursada

Nos encontramos pronto!
A

En las prácticas trabajaremos con Guías de Ejercicios y Trabajos Prácticos Computacionales. Los trabajos computacionales los haremos en Google Colab, una interfaz gratuita que permite programar online en lenguaje Python o R (pueden elegir aquel que prefieran). La interfaz funciona con celdas o módulos de código donde uno va escribiendo el programa y celdas de texto donde se puede separar en secciones y hacer comentarios. Para quien conozca, es igual a un Jupyter Notebook. Tiene la ventaja (muy grande en estos tiempos virtuales) de que pueden editar los trabajos en conjunto y quedan guardadas automáticamente todas las versiones en el drive online de la cuenta de Google. Es necesario que tengan cuenta de Google (la de Gmail funciona). Aquí van los tutoriales para hacerse cuenta en caso de que no tengan y para aprender a usar lo básico de Google Colab:

Tutorial del profesor Depine para crearse una cuenta de Google (gracias Depine)

Tutorial de Google Colab 

Por otra parte, la mayoría de ustedes contestó la encuesta sobre programación indicando que sabe algo más de Python así que decidimos enfocar la práctica en este lenguaje, pero no es necesario que sepan programar de antemano ni que lo hagan en Python, aunque en este último caso seguramente podremos responder mejor las consultas. Dejo aquí un tutorial para aprender a programar en Python desde 0. Quiénes no hayan programado nunca vayan mirándolo y quiénes sepan algo probablemente ya estén familiarizados con la mayoría del contenido, pero péguenle una mirada.

Python en Google Colab 

Por último, la librería de Python que utilizaremos específica para trabajar con Redes es Networkx, aquí el tutorial para que lo vayan viendo. Quienes no estén familiarizados con Python, arranquen primero por el tutorial de Python.

Networkx en Google Colab

Dejamos todos los tutoriales en la pestaña de Material Adicional.

Estamos viviendo tiempos tumultuosos en todo sentido y el ambito cientifico no es la excepcion. No solo numerosos grupos de muy diversas disciplinas se estan abocando a tratar de resolver porblemas relacionados con la actual pandemia, sino que la manera de compartir resultados ha cambiado vertiginosamente. Un ejemplo de esto lo pueden ver en este sitio [ link ] donde el grupo de Laszlo Barabasi, uno de los referentes mundiales en el area de redes complejas, ha decidio compartir una vitacora contando (someramente) resultados parciales de sus investigaciones relacionadas con Covid-19.

En sus palabras “…Network Medicine offers a series of powerful tools to identify new drugs and diagnostics. In this exceptional moment of need, we decided to turn the BarabasiLab‘s intellectual resources and network medicine toolset to aid the hunt for a treatment for the COVID-19.”

En todo caso, es lindo material para que vayan pispeando el tipo de cosas que es posible relevar con el abordaje que presentaremos en la materia.

Como veremos en la primera clase, la simplicidad de interacciones a escala local puede dar lugar a comportamientos y patrones muy complejos que ocurren en escalas espacio-temporales macroscopicas. Para ir entrando en calor aca va este videito … mini introduccion al concepto de sistemas complejos.